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如何为企业实施好LIMS系统
2017-06-14 16:28:22  作者:杨元儒   来源:互联网
  •   “三分技术,七分管理”是对LIMS系统开发与实施的高度评价,在Lims实施的过程中会出现很多我们所预想不到的问题,当然我们要采取相应的措施来解决,实施Lims的道路是一条曲折、充满挑战的道路,但同时也是实 ...

  “三分技术,七分管理”是对LIMS系统开发与实施的高度评价,在Lims实施的过程中会出现很多我们所预想不到的问题,当然我们要采取相应的措施来解决,实施Lims的道路是一条曲折、充满挑战的道路,但同时也是实现实验室信息化的必由之路。在初步实施Lims时,化验员既不能完全摆脱原有的手工记录数据的工作模式,又要使用Lims来进行电子文档管理,这样确实给实验员增大了工作量。对管理者来讲,改变已习惯的旧的管理手段,使用新的信息化、扁平化的管理方式,可能会带来利益上的冲突。Lims的开发商也不可能满足实验室提出的所有要求。此时,实验室人员对Lims的实施会产生抵触情绪,进而以程序繁琐、格式死板、初始化工作量大等为借口,拖延Lims的实施进度。由于实施周期延长,导致Lims开发商与实验室双方都被拖得很辛苦。如果此时再出现一些不易解决的问题,则很可能改变双方友好合作关系,实施过程就变得更加漫长、艰难,下面就实施的方法和经验为大家谈谈。

  一、LIMS实施方法

  系统文件夹(Folder)是进行数据处理用的对象的动态集合(接受样品、输入结果等)。文件夹对象包括样品、检测或者结果;数据审批(Data Revie w)是批准、取消或拒绝数据的过程。批准(Authrized),批准的数据是经过核准的数据。分析(Analysis),一个方法定义,或一个规程的描述。分项(Component)一个期望结果的描述;检测单(Test List)分析列表,一个检测的轮廓,为了易于分配给一个样品的分析项目清单,允许同时给一个样品分配一组分析,检测单是可选的;样品(Sample)检测用的单个试样;检测(Test)加给一个样品的单个步骤,分配给一个样品的一个分析特例,保存检测数据的地方,结果(Result)物理的度量,包括原始数据和最终数据。给样品安排分析,以创建检测,为每个分配的分析创建一个新的检测记录,分析的信息复制到检测记录中,分析等于方法描述,检测等于数据的占位单元,当给一个样品分配一个分析时,就创建一个相应的检测记录。检测记录的关键是检测号,这是系统生成的、识别该检测记录的唯一编号,用户一般不需要知道检测号,信息然后从分析记录复制到新的检测记录中。两个表中同名的所有字段的信息都从分析记录复制到检测记录。这些包括检测优先级、检测地点、实验室、分配的操作员和仪器。

  

分析和检测的关系

  图1 分析和检测的关系

  二、动态数据和静态数据

  静态数据,不会按天改变的信息,系统设置和定义的信息,分析或方法、客户、产品,样品和项目的登记模板。动态数据,逐日改变的数据每天的采样、测量和检测样品、检测和结果。动态数据,是按天输入LIMS的分析数据;静态数据包括初始系统组态和表设置所需的信息,同时,这些数据也可能过一段时间偶尔有些变化,但不是天天变。

  

活动记录模版

  图2 活动记录模版

  活动记录模板用来创建活动记录,样品使用样品模板登录,根据需要登记的不同样品类型,有相应的不同样品模板。分析是方法模板,它定义一个分析的概要,包括仪器、报告名等。一个分析分配给一个样品,就建立了该分析的一个特例,这称为检测。因此,分析是静态的方法定义,而检测是该分析用于一个样品的动态例子,分项是结果模板。它给结果命名,定义该结果的属性,包括期望的数据类型(例如,数值型、文本、或计算型)。当分析分配给一个样品建立了一个检测记录时,该分析的相应分项用来创建该检测的结果记录。

  

静态数据的体系结构

  图3 静态数据的体系结构

  项目模板用来创建和修改项目,它定义项目级的信息,样品模板用来登录和修改样品,它定义各种样品的接口环境,分析是方法的定义,它定义方法特定的信息,分项是预期结果的定义,它定义各结果的需求。

  

动态数据的体系结构

  图4 动态数据的体系结构

  项目是样品的组合,以便于进行组织。项目可以包含很多样品,样品可以只属于一个项目,每个样品可以分配很多检测,检测只属于一个样品,每个检测可以有很多相关的结果。结果只属于一个检测,每个结果代表一个数据或测量值。

  三、样品的生命期

  

样品的生命期

  图5 样品的生命期

  样品的状态有未收到(U) 、未完成(I)、处理中(P) 、完成(C) 、批准(A)、拒绝(R) 和取消(X),未收到的样品已经在系统中登录,但是实际上还没有收到。因此,它可以用于工作量预估报告,但在“收到”以前,系统不允许用它进行结果输入或处理,接受样品的操作使其状态从未收到变为未完成,此后,该样品可以用于检测,批准的样品只有在给该样品分配别的检测时,才能可以恢复到先前的状态。一旦结果被批准,就不能修改,拒绝或取消的样品将不会在结果输入屏幕或报告等中显示。但是,信息仍然在数据库中,可以用于调整的需要。

  四、检测的生命期

  

检测的生命期

  图6 检测的生命期

  检测的状态是未完成(I)、处理中(P)、完成(C)、批准(A)、拒绝(R)和取消(X)。检测的生命周期如上图所示,一个检测的初始状态是未完成。一个检测可以有几个结果。如果某些结果的值已经输入,但不是所有结果值都输入了,检测状态变为处理中。所有结果值都输入以后,或剩余的结果取消了,该检测变为完成。如果给该检测加进自定义的结果,则一个完成的样品可能返回到处理中,具有I、P或C状态的检测可以被取消,这时状态变为X。使用恢复操作可以使取消的检测恢复原来的状态,完成的检测能够被批准或拒绝,一个被拒绝的检测可以被批准。

  五、结果的生命期

  

结果的生命期

  图7 结果的生命期

  结果的状态是:未输入(N)、输入(E)、修改(M)、批准(A)、拒绝(R)和取消(X)。结果的生命周期如上图所示。

  六、项目的生命期

  

项目的生命期

  图8 项目的生命期

  所有动态的实体都有一个状态和生命期。 项目生命期如上所示,一个项目的状态由该项目所有样品的状态推导而来。项目的状态是未收到(U)、未完成(I)、处理中(P)、完成(C)、审批(V) 和取消(X),一个项目未收到,表明它的所有样品没有收到,一个项目未完成,表明它的所有样品没有收到,或是未完成,或是处理中,而且至少有一个样品是未完成,一个项目在处理中,表明它的所有样品没有收到,或是未完成,或是处理中,而且至少有一个样品是处理中,一个项目完成,表明它的所有样品都是完成,或复查,但不是所有样品都已经复查,如果一个项目的所有样品都审批了,该项目是审批,如果一个项目的所有样品都取消了,该项目为取消。



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